原来你是这样的软连接
发布时间：2022-11-19 11:16:11 所属栏目：Linux 来源：
导读： Linux系统下，软连接是我们常用来方便文件快速访问，节省空间，保证文件内容统一，简化环境变量设置的一个方式。使用起来也很简单 ln -s source target就可以搞定，但它总有调皮的时候。
文件目录结构如
文件目录结构如
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Linux系统下，软连接是我们常用来方便文件快速访问，节省空间，保证文件内容统一，简化环境变量设置的一个方式。使用起来也很简单 ln -s source target就可以搞定，但它总有调皮的时候。 文件目录结构如下所示，想把当前目录下的ehbio.fa链接到~/data目录下，按如下操作发现链接后的文件访问不了，提示符号连接的层数过多，仔细查看时原来是出现了一个自己指向自己的链接。问题出在建立软连接时源文件未使用全路径。 ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls ehbio3.fa ?ehbio4.fa ?ehbio5.fa ?ehbio6.fa ?ehbio.fa ?second.fa ct@ehbio:~/ehbio_project$ ln -s ehbio.fa ~/data ct@ehbio:~/ehbio_project$ less ~/data/ehbio.fa /home/ct/data/ehbio.fa: 符号连接的层数过多 ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls -l ~/data 总用量 4 lrwxrwxrwx 1 ct ct ? 8 6月 ?21 15:48 ehbio.fa -> ehbio.fa -rw-rw-r-- 1 ct ct 284 6月 ? 8 2017 first.fa 正确方式是：pwd使用命令代替当前路径名，适合任何目录。 ct@ehbio:~/ehbio_project$ ln -sf `pwd`/ehbio.fa ~/data ct@ehbio:~/ehbio_project$ ls -l ~/data 总用量 4 lrwxrwxrwx 1 ct ct ?31 6月 ?21 16:00 ehbio.fa -> /home/ct/ehbio_project/ehbio.fa -rw-rw-r-- 1 ct ct 284 6月 ? 8 2017 first.fa 使用全路径名，尤其使用家目录 ~ 符号时，只限操作用户自身有效。另外不同用户之间建立软连接，需要考虑访问权限问题，任意一层目录都需要可读权限 (目录的可读为rx都有)。 关于，我们之前有过介绍。当然最全的文档可以后台回复生信宝典福利第一波获取。这些内容中提到，如果觉得环境变量设置太繁琐了linux软链接，那么建立一个目录比如~/bin，只需把这个目录放入环境变量 export PATH=~/bin:$PATH，以后新安装的软件，都把可执行程序软链到~/bin目录下，直接可用。 前几天这个使用方式竟然也出了个诡异的问题，比如运行bwa时，出现符号连接的层数过多，但是使用全路径运行无问题，说明不是bwa链接出错了。问题就应该是出在环境变量所包括的目录中了，确实是有个目录是软连接失效。 （编辑：开发网_新乡站长网） 【声明】本站内容均来自网络，其相关言论仅代表作者个人观点，不代表本站立场。若无意侵犯到您的权利，请及时与联系站长删除相关内容! |
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